Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms