Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zscan5bB2RTN3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms