Protein–RNA interactions for Protein: B1AVN5

Zfp990, Zinc finger protein 990, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp990B1AVN5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp990B1AVN5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp990B1AVN5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms