Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms