Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms