Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cfap221A9Q751 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap221A9Q751 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms