Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmpd1A2AKB4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms