Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ambra1A2AH22 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ambra1A2AH22 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms