Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms