Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam50bQ9WTJ8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms