Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Wdr54Q9R0D8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr54Q9R0D8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms