Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ripk3Q9QZL0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ripk3Q9QZL0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms