Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tomm40Q9QYA2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms