Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf3Q9QXK7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms