Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Limd1Q9QXD8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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