Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trpc5Q9QX29 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms