Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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