Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.6 ms