Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ush1cQ9ES64 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ush1cQ9ES64 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms