Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rnft1Q9DCN7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rnft1Q9DCN7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rnft1Q9DCN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Rnft1Q9DCN7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Rnft1Q9DCN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rnft1Q9DCN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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