Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SrpraQ9DBG7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms