Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg9Q9DB90 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smg9Q9DB90 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms