Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfrsf13cQ9D8D0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms