Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp4cQ9D7F7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp4cQ9D7F7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms