Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nop56Q9D6Z1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nop56Q9D6Z1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nop56Q9D6Z1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nop56Q9D6Z1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nop56Q9D6Z1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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