Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs6Q9D6W8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms