Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rtl8cQ9D6I0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rtl8cQ9D6I0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms