Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9bQ9D6E4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9bQ9D6E4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms