Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf1Q9D2H9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf1Q9D2H9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms