Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef12Q9D2F1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms