Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx56Q9D0R4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddx56Q9D0R4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms