Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ribc1Q9D0B8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ribc1Q9D0B8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ribc1Q9D0B8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ribc1Q9D0B8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms