Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc47Q9D024 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms