Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2v1Q9CZY3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms