Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Elp3Q9CZX0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms