Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Thumpd2Q9CZB3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms