Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ddx28Q9CWT6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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