Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sycp2Q9CUU3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms