Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sppl3Q9CUS9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms