Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930519P11RikQ9CUJ8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms