Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snw1Q9CSN1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms