Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ6

Ndufb3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb3Q9CQZ6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufb3Q9CQZ6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms