Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim8Q9CQQ0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim8Q9CQQ0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms