Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms