Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms