Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl17Q9CPR4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms