Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramel1Q99MW3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms