Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CalcbQ99MP3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CalcbQ99MP3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CalcbQ99MP3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CalcbQ99MP3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CalcbQ99MP3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms