Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms