Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp11Q99K46 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms